日本全国分为47个一级行政区分为1都（东京都：Tokyo）、1道（北海道：Hokkaido）、2府（大阪府：Osaka、京都府：Kyoto）和43县（県），下设市、町、村。 

部分偏远地区、离岛地区设立都道府县的行政派出机关“支厅”，近年多改制并更名为“县民局”、“振兴局”等。

与市同级的“郡”，1920年代开始虚级化，仍具备地址表记、广域行政圈范围、都道府县议会选举划分等功能。

截止2007年4月1日，都道府县下设782个市、827个町、195个村。另外东京都下设23个特别区（法律地位为“特别地方公共团体”，与政令市的行政权限类似，唯为确保大都市的行政一体性，如上下水道、消防等事务，仍由“都”负责），北海道下有14个支厅，为特别地方政府。

「東京都」和「大阪府」「京都府」

刚进入明治时代，政府把由江户幕府直接管辖的地区做了区分，比较重要的、由奉行管辖的地区称为“府”，由代官管辖的地区就称为“县”。

比如：江户府（今东京都）、甲斐府（今山梨县）、京都府、长崎府（今长崎县）、都会府（今三重县）等等。

到了明治2年，政府进行行政区划改革。

东京是行政中心，京都是天皇的住所，大阪是经济中心。

为了强调这三个地方的重要性，就单独保留了“江户府”、“大阪府”和“京都府”。

而“江户府”又经过了“废藩置县”等多次调整，最后在1943年，东京府和东京市合并，成为了今天的“东京都”。

至此，日本形成了如今的1都1道2府43县的行政区划。